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L'ARN peut former une hélice identique à celle de l'ADN grâce à 3 liaisons H entre C et G et 2 entre A et U. La différence avec l'ADN est la présence d'un seul brin (l'ADN par contre est formé de 2 chaînes), donc il peut se replier sur lui même. La plupart du temps on a des liaisons H dites Watson Crick qui sont à l'origine des structures en tige boucle. Watson et Crick sont les biologistes qui ont découvert la structure en double hélice d'ADN en 1958.

structure tige boucle

On peut aussi avoir des liaisons H de type Hoogsteen, mais c'est plus rare, on les trouve principalement dans des tRNA, par exemple entre les boucles t phi et d :

structures Watson Crick et Hoogsteen

Ou encore dans les pseudonoeuds :

pseudonoeud

Les structures secondaires de l'ARN permettent d'obtenir des molécules plus stables, ayant une structure tertiaire donnée, donc d'avoir une fonction catalytique donnée.

travian